UTILS.
100% w przeglądarce
↩️

Kalkulator odwrotnego komplementu

Uzyskaj odwrotny komplement, komplement i odwrócenie sekwencji DNA lub RNA, z obsługą kodów niejednoznaczności IUPAC.

wynik

O tym narzędziu

Wklej sekwencję nukleotydów, aby obliczyć jej odwrotny komplement — sekwencję nici przeciwnej odczytaną w kierunku 5′→3′. Dane wejściowe są zamieniane na wielkie litery i ograniczane do prawidłowych zasad i kodów niejednoznaczności IUPAC. Działa całkowicie w Twojej przeglądarce.

Każda zasada jest komplementowana przy użyciu mapy uwzględniającej IUPAC: A↔T, G↔C, plus pary niejednoznaczności takie jak R↔Y, K↔M, W↔W, S↔S, B↔V, D↔H i N↔N. Komplement to ta mapa zastosowana zasada po zasadzie, odwrócenie to sekwencja zapisana wstecz, a odwrotny komplement to komplement zapisany wstecz. W trybie RNA wynik używa U zamiast T.

Wyświetlane są wszystkie trzy wyniki, przy czym odwrotny komplement jest wyróżniony i można go skopiować. Na przykład GATTACA ma komplement CTAATGT i odwrotny komplement TGTAATC.

Najczęściej zadawane pytania

Czym jest odwrotny komplement?
To sekwencja nici komplementarnej odczytana od jej końca 5′. Komplementujesz każdą zasadę (A↔T, G↔C), a następnie odwracasz kolejność, uzyskując antyrównoległą nić partnerską.
Czy obsługuje kody niejednoznaczności IUPAC?
Tak. Zdegenerowane zasady takie jak R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V i N są komplementowane do swoich prawidłowych partnerów (na przykład R↔Y i K↔M).
Jaka jest różnica między trzema wynikami?
Komplement zamienia każdą zasadę bez zmiany kolejności; odwrócenie zapisuje pierwotną sekwencję wstecz bez zamiany; odwrotny komplement robi jedno i drugie.
Czym różni się tryb RNA?
W trybie RNA wynik używa uracylu (U) zamiast tyminy (T); reguły komplementacji są poza tym identyczne.

Więcej narzędzi