このツールについて
ヌクレオチド配列を貼り付けると、その逆相補鎖 — 反対側の鎖を 5′→3′ 方向に読んだ配列 — を計算します。入力は大文字化され、有効な塩基と IUPAC の曖昧塩基コードに限定されます。すべてブラウザ内で実行されます。
各塩基は IUPAC 対応のマップを用いて相補されます:A↔T, G↔C に加え、R↔Y, K↔M, W↔W, S↔S, B↔V, D↔H, N↔N といった曖昧塩基のペアです。相補鎖はそのマップを塩基ごとに適用したもの、逆配列は配列を逆向きに書いたもの、逆相補鎖は相補鎖を逆向きに書いたものです。RNA モードでは出力に T の代わりに U を使います。
3つの結果すべてが表示され、逆相補鎖が強調表示されコピー可能です。例えば、GATTACA の相補鎖は CTAATGT、逆相補鎖は TGTAATC です。
よくある質問
逆相補鎖とは何ですか?
相補鎖をその 5′ 末端から読んだ配列です。各塩基を相補し(A↔T, G↔C)、その順序を逆にすることで、逆平行のパートナー鎖が得られます。
IUPAC の曖昧塩基コードに対応していますか?
はい。R, Y, S, W, K, M, B, D, H, V, N といった縮重塩基は、正しいパートナーに相補されます(例えば R↔Y や K↔M)。
3つの出力の違いは何ですか?
相補鎖は順序を変えずに各塩基を置換します。逆配列は置換せずに元の配列を逆向きに書きます。逆相補鎖はその両方を行います。
RNA モードはどう違いますか?
RNA モードでは、出力にチミン(T)の代わりにウラシル(U)を使います。それ以外の相補ルールは同一です。