このツールについて
DNA または RNA 配列を貼り付けて、その塩基組成を測定します。配列は大文字化され A, C, G, T, U に絞り込まれてから、各塩基がカウントされます。すべてブラウザ内でローカルに計算されます。
GC 含量はグアニンまたはシトシンである塩基の割合です：GC% = (G + C) / 総数 × 100。AT 含量は単純に 100 − GC% です。GC スキューは (G − C) / (G + C) として定義され、鎖の偏りを示し、複製起点の特定によく使われます。塩基数と総長もこれらの数値とともに報告されます。
オプションのウィンドウサイズは、配列を連続したセグメントに分割し、それぞれの局所 GC% を一覧表示するため、GC に富む領域や GC の乏しい領域を見つけるのに役立ちます。例えば配列 GGCC は GC 100% ですが、バランスの取れた配列は 50% 付近になります。
よくある質問
GC 含量はどのように計算されますか？
G と C の塩基数を塩基の総数で割り、パーセントで表したものです：GC% = (G + C) / 長さ × 100。AT 含量は残りの 100 − GC% です。
GC スキューとは何ですか？
GC スキューは (G − C) / (G + C) です。ゼロより大きい値はその鎖にシトシンよりグアニンが多いことを意味し、複製の起点と終点を特定するのによく使われます。
ウィンドウサイズは何をしますか？
配列をその長さの連続したブロックに分割し、各ブロックの GC% を報告するため、GC 含量が配列に沿ってどのように変化するかを見ることができます。
RNA でも機能しますか？
はい。ウラシル（U）はチミン（T）とともにカウントされるため、RNA と DNA の両方の配列で正しい GC 含量と AT 含量が得られます。