UTILS.
100 % im Browser
📊

GC-Gehalt-Rechner

Berechne GC- und AT-Gehalt, Basenzählungen, GC-Skew und optional den lokalen GC%-Wert im gleitenden Fenster für eine DNA- oder RNA-Sequenz.

Über dieses Tool

Füge eine DNA- oder RNA-Sequenz ein, um ihre Basenzusammensetzung zu messen. Die Sequenz wird in Großbuchstaben umgewandelt und auf A, C, G, T und U reduziert, dann wird jede Base gezählt. Alles wird lokal in deinem Browser berechnet.

Der GC-Gehalt ist der Anteil der Basen, die Guanin oder Cytosin sind: GC% = (G + C) / gesamt × 100. Der AT-Gehalt ist einfach 100 − GC%. Der GC-Skew, definiert als (G − C) / (G + C), zeigt eine Strangverzerrung an und wird oft zur Lokalisierung von Replikationsursprüngen verwendet. Basenzählungen und Gesamtlänge werden neben diesen Kennzahlen angezeigt.

Eine optionale Fenstergröße teilt die Sequenz in aufeinanderfolgende Segmente und listet den lokalen GC%-Wert jedes einzelnen auf, was dir hilft, GC-reiche oder GC-arme Regionen zu erkennen. Zum Beispiel ist die Sequenz GGCC zu 100 % GC, während eine ausgeglichene Sequenz nahe 50 % liegt.

Häufig gestellte Fragen

Wie wird der GC-Gehalt berechnet?
Es ist die Anzahl der G- und C-Basen geteilt durch die Gesamtzahl der Basen, ausgedrückt als Prozentsatz: GC% = (G + C) / Länge × 100. Der AT-Gehalt ist der verbleibende Anteil 100 − GC%.
Was ist der GC-Skew?
Der GC-Skew ist (G − C) / (G + C). Ein Wert über null bedeutet mehr Guanin als Cytosin auf diesem Strang; er wird häufig zur Identifizierung von Replikationsursprüngen und -enden verwendet.
Was bewirkt die Fenstergröße?
Sie teilt die Sequenz in aufeinanderfolgende Blöcke dieser Länge und meldet den GC%-Wert jedes Blocks, sodass du sehen kannst, wie der GC-Gehalt entlang der Sequenz variiert.
Funktioniert es für RNA?
Ja. Uracil (U) wird zusammen mit Thymin (T) gezählt, sodass sowohl RNA- als auch DNA-Sequenzen korrekte GC- und AT-Prozentwerte ergeben.

Weitere Tools