Sobre esta ferramenta
Cole uma sequência de DNA ou RNA para medir sua composição de bases. A sequência é convertida para maiúsculas e reduzida a A, C, G, T e U, então cada base é contada. Tudo é calculado localmente no seu navegador.
O conteúdo GC é a fração de bases que são guanina ou citosina: GC% = (G + C) / total × 100. O conteúdo AT é simplesmente 100 − GC%. O GC skew, definido como (G − C) / (G + C), indica viés de fita e é frequentemente usado para localizar origens de replicação. Contagens de bases e comprimento total são reportados junto com esses valores.
Um tamanho de janela opcional divide a sequência em segmentos consecutivos e lista o GC% local de cada um, o que ajuda a identificar regiões ricas ou pobres em GC. Por exemplo, a sequência GGCC é 100% GC, enquanto uma sequência equilibrada fica perto de 50%.