À propos de cet outil
Collez une séquence d'ADN ou d'ARN pour mesurer sa composition en bases. La séquence est mise en majuscules et réduite à A, C, G, T et U, puis chaque base est comptée. Tout est calculé localement dans votre navigateur.
La teneur en GC est la fraction de bases qui sont de la guanine ou de la cytosine : GC% = (G + C) / total × 100. La teneur en AT est simplement 100 − GC%. Le biais GC, défini comme (G − C) / (G + C), indique un déséquilibre de brin et sert souvent à localiser les origines de réplication. Les effectifs de bases et la longueur totale sont indiqués aux côtés de ces valeurs.
Une taille de fenêtre facultative découpe la séquence en segments consécutifs et liste le GC% local de chacun, ce qui aide à repérer les régions riches ou pauvres en GC. Par exemple, la séquence GGCC est à 100% GC, tandis qu'une séquence équilibrée se situe près de 50%.