इस टूल के बारे में
इसके बेस संघटन को मापने के लिए एक DNA या RNA अनुक्रम पेस्ट करें। अनुक्रम को बड़े अक्षरों में बदला जाता है और A, C, G, T और U तक घटाया जाता है, फिर प्रत्येक बेस गिना जाता है। सब कुछ आपके ब्राउज़र में स्थानीय रूप से गणना किया जाता है।
GC कंटेंट उन बेसों का अंश है जो ग्वानीन या साइटोसीन हैं: GC% = (G + C) / कुल × 100। AT कंटेंट बस 100 − GC% है। GC स्क्यू, जिसे (G − C) / (G + C) के रूप में परिभाषित किया जाता है, स्ट्रैंड पूर्वाग्रह को दर्शाता है और अक्सर प्रतिकृति उद्गम खोजने के लिए उपयोग होता है। बेस गिनती और कुल लंबाई इन आँकड़ों के साथ सूचित की जाती है।
एक वैकल्पिक विंडो आकार अनुक्रम को लगातार खंडों में विभाजित करता है और प्रत्येक का स्थानीय GC% सूचीबद्ध करता है, जो आपको GC-समृद्ध या GC-रहित क्षेत्रों को पहचानने में मदद करता है। उदाहरण के लिए अनुक्रम GGCC 100% GC है, जबकि एक संतुलित अनुक्रम 50% के करीब रहता है।