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प्रोटीन आणविक भार और pI कैलकुलेटर

एक-अक्षर अमीनो-अम्ल अनुक्रम से प्रोटीन का आणविक भार Da/kDa में और इसका समविभव बिंदु (pI) गणना करें।

इस टूल के बारे में

प्रोटीन आणविक भार और pI कैलकुलेटर एक मुफ्त, इन-ब्राउज़र टूल है जो एक प्रोटीन या पेप्टाइड के आणविक भार और सैद्धांतिक समविभव बिंदु की इसके एक-अक्षर अमीनो-अम्ल अनुक्रम से गणना करता है। अनुक्रम पेस्ट करें और यह डाल्टन व किलोडाल्टन में भार, अवशेषों में लंबाई, अनुमानित pI, और अमीनो-अम्ल संघटन लौटाता है। सभी गणना आपके ब्राउज़र में स्थानीय रूप से होती है और अनुक्रम कभी कहीं नहीं भेजा जाता।

आणविक भार 20 मानक औसत अवशेष द्रव्यमानों का योग (उदाहरण के लिए Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da) साथ ही मुक्त N- और C-छोरों के लिए 18.02 Da जल है। समविभव बिंदु शुद्ध आवेश को pH के फलन के रूप में Henderson–Hasselbalch समीकरण से आयनीकरणीय समूहों — N-छोर, C-छोर, और Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys, और Arg की पार्श्व शृंखलाओं — पर मानक pKa मानों का उपयोग करके लिखकर, फिर 0 और 14 के बीच pH को द्विभाजित करके पाया जाता है जब तक शुद्ध आवेश शून्य को पार न कर ले।

धनात्मक समूह (N-छोर, His, Lys, Arg) 1/(1+10^(pH−pKa)) योगदान देते हैं और ऋणात्मक समूह (C-छोर, Asp, Glu, Cys, Tyr) −1/(1+10^(pKa−pH)) योगदान देते हैं। pI एक सैद्धांतिक अनुमान है; वास्तविक मान तापमान, आयनिक शक्ति, और अनुवाद-पश्चात संशोधनों के साथ बदलते हैं, जिन्हें यह केवल-अनुक्रम विधि मॉडल नहीं करती।

अक्सर पूछे जाने वाले प्रश्न

आणविक भार कैसे गणना किया जाता है?
यह आपके अनुक्रम में 20 अमीनो अम्लों के औसत अवशेष द्रव्यमानों का योग करता है और छोर जल के लिए 18.02 Da जोड़ता है, जिससे डाल्टन में औसत आणविक भार मिलता है; 1000 से विभाजित करने पर किलोडाल्टन मिलता है।
समविभव बिंदु कैसे पाया जाता है?
शुद्ध आवेश को मानक pKa मानों का उपयोग करते हुए आयनीकरणीय समूहों पर Henderson–Hasselbalch पदों के योग के रूप में लिखा जाता है, फिर यह पता लगाने के लिए pH को 0 और 14 के बीच द्विभाजित किया जाता है कि शुद्ध आवेश शून्य के बराबर कहाँ होता है — वह pH pI है।
कौन-से समूह pI को प्रभावित करते हैं?
N-छोर और C-छोर साथ ही एस्पार्टेट (D), ग्लूटामेट (E), सिस्टीन (C), टायरोसीन (Y), हिस्टिडीन (H), लाइसीन (K), और आर्जिनीन (R) की पार्श्व शृंखलाएँ। उनकी गिनती और pKa मान तय करते हैं कि शुद्ध आवेश शून्य को कहाँ पार करता है।
अनुमानित pI कितना सटीक है?
यह अकेले अनुक्रम से एक सैद्धांतिक मान है और आमतौर पर मापे गए मानों के pH इकाई के कुछ दहाई के भीतर होता है। यह त्रि-आयामी संरचना, संशोधन, तापमान, और आयनिक शक्ति को अनदेखा करता है, इसलिए इसे एक मार्गदर्शक के रूप में लें।

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