Bu araç hakkında
Protein Molekül Ağırlığı ve pI Hesaplayıcı, bir protein veya peptidin molekül ağırlığını ve teorik izoelektrik noktasını tek harfli amino asit dizisinden hesaplayan ücretsiz, tarayıcı içi bir araçtır. Diziyi yapıştırın; ağırlığı dalton ve kilodalton cinsinden, kalıntı cinsinden uzunluğu, tahmini pI'yi ve amino asit bileşimini döndürür. Tüm hesaplama tarayıcınızda yerel olarak gerçekleşir ve dizi asla hiçbir yere gönderilmez.
Molekül ağırlığı, 20 standart ortalama kalıntı kütlesinin (örneğin Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da) toplamı artı serbest N- ve C-uçları için 18.02 Da su'dur. İzoelektrik nokta, net yükün, iyonlaşabilir gruplar üzerinden — N-ucu, C-ucu ve Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys ve Arg yan zincirleri — Henderson–Hasselbalch denklemi ile pH'ın bir fonksiyonu olarak yazılıp, standart pKa değerleri kullanılarak, net yük sıfırı geçene kadar pH'ın 0 ile 14 arasında ikiye bölünmesiyle bulunur.
Pozitif gruplar (N-ucu, His, Lys, Arg) 1/(1+10^(pH−pKa)) katkısı yapar ve negatif gruplar (C-ucu, Asp, Glu, Cys, Tyr) −1/(1+10^(pKa−pH)) katkısı yapar. pI teorik bir tahmindir; gerçek değerler sıcaklık, iyonik güç ve bu yalnızca diziye dayalı yöntemin modellemediği translasyon sonrası modifikasyonlarla değişir.