Over deze tool
De Eiwit-molecuulgewicht & pI Calculator is een gratis, in-browser tool die het molecuulgewicht en het theoretische iso-elektrisch punt van een eiwit of peptide berekent uit de aminozuursequentie met één letter. Plak de sequentie en hij geeft het gewicht in dalton en kilodalton, de lengte in residuen, het geschatte pI en de aminozuursamenstelling terug. Alle berekeningen gebeuren lokaal in je browser en de sequentie wordt nooit ergens naartoe gestuurd.
Het molecuulgewicht is de som van de 20 standaard gemiddelde residumassa's (bijvoorbeeld Ala 71,08, Gly 57,05, Trp 186,21 Da) plus 18,02 Da water voor de vrije N- en C-termini. Het iso-elektrisch punt wordt gevonden door de nettolading als functie van de pH te schrijven met de Henderson–Hasselbalch-vergelijking over de ioniseerbare groepen — de N-terminus, C-terminus en de zijketens van Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys en Arg — met standaard pKa-waarden, en vervolgens de pH tussen 0 en 14 te bisecteren totdat de nettolading nul kruist.
Positieve groepen (N-terminus, His, Lys, Arg) dragen 1/(1+10^(pH−pKa)) bij en negatieve groepen (C-terminus, Asp, Glu, Cys, Tyr) dragen −1/(1+10^(pKa−pH)) bij. Het pI is een theoretische schatting; echte waarden verschuiven met temperatuur, ionsterkte en posttranslationele modificaties, die deze op-sequentie-gebaseerde methode niet modelleert.