Про цей інструмент
Калькулятор молекулярної маси та pI білка — це безкоштовний браузерний інструмент, який обчислює молекулярну масу та теоретичну ізоелектричну точку білка чи пептиду з його однобуквеної амінокислотної послідовності. Вставте послідовність, і він поверне масу в дальтонах і кілодальтонах, довжину в залишках, оцінену pI та амінокислотний склад. Усі обчислення відбуваються локально у вашому браузері, і послідовність ніколи нікуди не надсилається.
Молекулярна маса — це сума 20 стандартних середніх мас залишків (наприклад Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da) плюс 18.02 Da води для вільних N- та C-кінців. Ізоелектрична точка знаходиться шляхом запису чистого заряду як функції pH за рівнянням Henderson–Hasselbalch по іонізовних групах — N-кінець, C-кінець і бічні ланцюги Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys та Arg — з використанням стандартних значень pKa, а потім методом бісекції pH між 0 і 14, доки чистий заряд не перетне нуль.
Позитивні групи (N-кінець, His, Lys, Arg) вносять 1/(1+10^(pH−pKa)), а негативні групи (C-кінець, Asp, Glu, Cys, Tyr) вносять −1/(1+10^(pKa−pH)). pI є теоретичною оцінкою; реальні значення зміщуються з температурою, іонною силою та посттрансляційними модифікаціями, які цей метод лише на основі послідовності не моделює.