Acerca de esta herramienta
La Calculadora de peso molecular y pI de proteínas es una herramienta gratuita en el navegador que calcula el peso molecular y el punto isoeléctrico teórico de una proteína o péptido a partir de su secuencia de aminoácidos de una letra. Pega la secuencia y devuelve el peso en dáltones y kilodáltones, la longitud en residuos, el pI estimado y la composición de aminoácidos. Todo el cálculo se realiza localmente en tu navegador y la secuencia nunca se envía a ningún sitio.
El peso molecular es la suma de las 20 masas medias estándar de residuos (por ejemplo Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da) más 18.02 Da de agua para los extremos N- y C-terminales libres. El punto isoeléctrico se halla escribiendo la carga neta en función del pH con la ecuación de Henderson–Hasselbalch sobre los grupos ionizables —el extremo N-terminal, el C-terminal y las cadenas laterales de Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys y Arg— usando valores de pKa estándar, y luego bisecando el pH entre 0 y 14 hasta que la carga neta cruza cero.
Los grupos positivos (N-terminal, His, Lys, Arg) contribuyen 1/(1+10^(pH−pKa)) y los grupos negativos (C-terminal, Asp, Glu, Cys, Tyr) contribuyen −1/(1+10^(pKa−pH)). El pI es una estimación teórica; los valores reales cambian con la temperatura, la fuerza iónica y las modificaciones postraduccionales, que este método basado solo en la secuencia no modela.