Về công cụ này
Máy tính khối lượng phân tử & pI protein là một công cụ miễn phí, chạy trong trình duyệt tính khối lượng phân tử và điểm đẳng điện lý thuyết của một protein hoặc peptide từ trình tự axit amin một chữ cái của nó. Dán trình tự và nó trả về khối lượng tính bằng dalton và kilodalton, chiều dài tính bằng gốc axit amin, pI ước tính, và thành phần axit amin. Mọi tính toán diễn ra cục bộ trong trình duyệt của bạn và trình tự không bao giờ được gửi đi đâu.
Khối lượng phân tử là tổng khối lượng gốc trung bình của 20 axit amin chuẩn (ví dụ Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da) cộng 18.02 Da nước cho các đầu N và C tự do. Điểm đẳng điện được tìm bằng cách viết điện tích thuần như một hàm của pH bằng phương trình Henderson–Hasselbalch trên các nhóm ion hóa được — đầu N, đầu C, và các chuỗi bên của Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys và Arg — dùng các giá trị pKa chuẩn, rồi chia đôi pH giữa 0 và 14 cho đến khi điện tích thuần vượt qua không.
Các nhóm dương (đầu N, His, Lys, Arg) đóng góp 1/(1+10^(pH−pKa)) và các nhóm âm (đầu C, Asp, Glu, Cys, Tyr) đóng góp −1/(1+10^(pKa−pH)). pI là một ước tính lý thuyết; các giá trị thực dịch chuyển theo nhiệt độ, cường độ ion và các biến đổi sau dịch mã, những điều mà phương pháp chỉ dựa vào trình tự này không mô hình hóa.