Tentang alat ini
Kalkulator Berat Molekul & pI Protein adalah alat gratis di peramban yang menghitung berat molekul dan titik isoelektrik teoretis suatu protein atau peptida dari sekuens asam amino satu hurufnya. Tempelkan sekuens dan ia mengembalikan berat dalam dalton dan kilodalton, panjang dalam residu, pI perkiraan, dan komposisi asam amino. Semua perhitungan terjadi secara lokal di peramban Anda dan sekuens tidak pernah dikirim ke mana pun.
Berat molekul adalah jumlah 20 massa residu rata-rata standar (misalnya Ala 71,08, Gly 57,05, Trp 186,21 Da) ditambah 18,02 Da air untuk ujung-N dan ujung-C bebas. Titik isoelektrik ditemukan dengan menuliskan muatan bersih sebagai fungsi pH dengan persamaan Henderson–Hasselbalch pada gugus terionisasi — ujung-N, ujung-C, dan rantai samping Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys, dan Arg — menggunakan nilai pKa standar, lalu membelah pH antara 0 dan 14 hingga muatan bersih melintasi nol.
Gugus positif (ujung-N, His, Lys, Arg) berkontribusi 1/(1+10^(pH−pKa)) dan gugus negatif (ujung-C, Asp, Glu, Cys, Tyr) berkontribusi −1/(1+10^(pKa−pH)). pI adalah perkiraan teoretis; nilai nyata bergeser dengan suhu, kekuatan ionik, dan modifikasi pascatranslasi, yang tidak dimodelkan oleh metode berbasis sekuens saja ini.