Informazioni su questo strumento
Il Calcolatore del peso molecolare e del pI di una proteina è uno strumento gratuito, in-browser, che calcola il peso molecolare e il punto isoelettrico teorico di una proteina o di un peptide dalla sua sequenza amminoacidica a una lettera. Incolla la sequenza e restituisce il peso in dalton e kilodalton, la lunghezza in residui, il pI stimato e la composizione amminoacidica. Tutto il calcolo avviene localmente nel tuo browser e la sequenza non viene mai inviata da nessuna parte.
Il peso molecolare è la somma delle 20 masse medie standard dei residui (per esempio Ala 71,08, Gly 57,05, Trp 186,21 Da) più 18,02 Da di acqua per i terminali N e C liberi. Il punto isoelettrico si trova scrivendo la carica netta in funzione del pH con l'equazione di Henderson–Hasselbalch sui gruppi ionizzabili — il N-terminale, il C-terminale e le catene laterali di Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys e Arg — usando valori di pKa standard, quindi bisecando il pH tra 0 e 14 finché la carica netta attraversa lo zero.
I gruppi positivi (N-terminale, His, Lys, Arg) contribuiscono con 1/(1+10^(pH−pKa)) e i gruppi negativi (C-terminale, Asp, Glu, Cys, Tyr) contribuiscono con −1/(1+10^(pKa−pH)). Il pI è una stima teorica; i valori reali variano con la temperatura, la forza ionica e le modifiche post-traduzionali, che questo metodo basato solo sulla sequenza non modella.