درباره این ابزار
ماشینحساب وزن مولکولی و pI پروتئین یک ابزار رایگان و درونمرورگری است که وزن مولکولی و نقطه ایزوالکتریک نظری یک پروتئین یا پپتید را از توالی آمینواسید تکحرفی آن محاسبه میکند. توالی را جایگذاری کنید و وزن را به دالتون و کیلودالتون، طول را به بقایا، pI تخمینی، و ترکیب آمینواسید را برمیگرداند. همه محاسبات بهصورت محلی در مرورگر شما انجام میشوند و توالی هرگز به جایی ارسال نمیشود.
وزن مولکولی برابر با مجموع ۲۰ جرم متوسط بقایای استاندارد (برای مثال Ala 71.08، Gly 57.05، Trp 186.21 Da) بهعلاوه 18.02 Da آب برای انتهاهای آزاد N و C است. نقطه ایزوالکتریک با نوشتن بار خالص بهعنوان تابعی از pH با معادله Henderson–Hasselbalch روی گروههای یونیزهشونده — انتهای N، انتهای C، و زنجیرههای جانبی Asp، Glu، Cys، Tyr، His، Lys و Arg — با استفاده از مقادیر استاندارد pKa پیدا میشود، سپس pH بین ۰ و ۱۴ نصف میشود تا بار خالص از صفر عبور کند.
گروههای مثبت (انتهای N، His، Lys، Arg) مقدار 1/(1+10^(pH−pKa)) و گروههای منفی (انتهای C، Asp، Glu، Cys، Tyr) مقدار −1/(1+10^(pKa−pH)) را مشارکت میدهند. pI یک تخمین نظری است؛ مقادیر واقعی با دما، قدرت یونی و اصلاحات پس از ترجمه تغییر میکنند، که این روش فقط-توالی آنها را مدلسازی نمیکند.