Sobre esta ferramenta
A Calculadora de Peso Molecular e pI de Proteína é uma ferramenta gratuita e no navegador que calcula o peso molecular e o ponto isoelétrico teórico de uma proteína ou peptídeo a partir de sua sequência de aminoácidos de uma letra. Cole a sequência e ela retorna o peso em daltons e quilodaltons, o comprimento em resíduos, o pI estimado e a composição de aminoácidos. Todo o cálculo acontece localmente no seu navegador e a sequência nunca é enviada a lugar algum.
O peso molecular é a soma das 20 massas médias de resíduo padrão (por exemplo Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da) mais 18.02 Da de água pelas extremidades N e C livres. O ponto isoelétrico é encontrado escrevendo a carga líquida como função do pH com a equação de Henderson–Hasselbalch sobre os grupos ionizáveis — a extremidade N, a extremidade C e as cadeias laterais de Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys e Arg — usando valores de pKa padrão, então bissectando o pH entre 0 e 14 até a carga líquida cruzar o zero.
Grupos positivos (extremidade N, His, Lys, Arg) contribuem com 1/(1+10^(pH−pKa)) e grupos negativos (extremidade C, Asp, Glu, Cys, Tyr) contribuem com −1/(1+10^(pKa−pH)). O pI é uma estimativa teórica; valores reais mudam com temperatura, força iônica e modificações pós-traducionais, que este método baseado apenas na sequência não modela.