UTILS.
‎100%‎ داخل المتصفح
📊

حاسبة الوزن الجزيئي و pI للبروتين

احسب الوزن الجزيئي للبروتين بوحدة Da/kDa ونقطته الكهروضوئية المتعادلة (pI) من تسلسل أحماض أمينية بحرف واحد.

حول هذه الأداة

حاسبة الوزن الجزيئي و pI للبروتين هي أداة مجانية داخل المتصفح تحسب الوزن الجزيئي والنقطة الكهروضوئية المتعادلة النظرية لبروتين أو ببتيد من تسلسل أحماضه الأمينية بحرف واحد. الصق التسلسل فتُرجِع الوزن بوحدتي دالتون وكيلودالتون، والطول بعدد البقايا، و pI المقدَّر، وتركيب الأحماض الأمينية. تجري كل العمليات الحسابية محلياً داخل متصفحك ولا يُرسَل التسلسل إلى أي مكان.

الوزن الجزيئي هو مجموع كتل البقايا المتوسطة القياسية العشرين (على سبيل المثال Ala 71.08 و Gly 57.05 و Trp 186.21 Da) إضافة إلى 18.02 Da من الماء للنهايتين الحرتين N و C. تُوجَد النقطة الكهروضوئية المتعادلة بكتابة الشحنة الصافية كدالة في pH بمعادلة هندرسون–هاسلباخ على المجموعات القابلة للتأين — النهاية N والنهاية C والسلاسل الجانبية لـ Asp و Glu و Cys و Tyr و His و Lys و Arg — باستخدام قيم pKa القياسية، ثم تنصيف pH بين 0 و 14 حتى تعبر الشحنة الصافية الصفر.

تُسهِم المجموعات الموجبة (النهاية N و His و Lys و Arg) بمقدار 1/(1+10^(pH−pKa))، وتُسهِم المجموعات السالبة (النهاية C و Asp و Glu و Cys و Tyr) بمقدار −1/(1+10^(pKa−pH)). إن pI تقدير نظري؛ فالقيم الحقيقية تتغير مع درجة الحرارة والقوة الأيونية والتعديلات بعد الترجمة، وهو ما لا تنمذجه هذه الطريقة المعتمِدة على التسلسل وحده.

الأسئلة الشائعة

كيف يُحسَب الوزن الجزيئي؟
يجمع كتل البقايا المتوسطة للأحماض الأمينية العشرين في تسلسلك ويضيف 18.02 Da لماء النهايتين، مما يعطي الوزن الجزيئي المتوسط بالدالتون؛ والقسمة على 1000 تعطي الكيلودالتون.
كيف تُوجَد النقطة الكهروضوئية المتعادلة؟
تُكتَب الشحنة الصافية كمجموع حدود هندرسون–هاسلباخ على المجموعات القابلة للتأين باستخدام قيم pKa القياسية، ثم يُنصَّف pH بين 0 و 14 لإيجاد حيث تساوي الشحنة الصافية صفراً — ذلك pH هو pI.
ما المجموعات التي تؤثر في pI؟
النهاية N والنهاية C إضافة إلى السلاسل الجانبية للأسبارتات (D) والغلوتامات (E) والسيستئين (C) والتيروزين (Y) والهيستيدين (H) والليسين (K) والأرجينين (R). تحدِّد أعدادها وقيم pKa الخاصة بها حيث تعبر الشحنة الصافية الصفر.
ما دقة pI المقدَّرة؟
هي قيمة نظرية من التسلسل وحده وعادةً ضمن أعشار قليلة من وحدة pH عن القيم المقيسة. تتجاهل البنية ثلاثية الأبعاد والتعديلات ودرجة الحرارة والقوة الأيونية، لذا عامِلها كدليل.

المزيد من الأدوات