이 도구에 대하여
단백질 분자량 & pI 계산기는 단백질 또는 펩타이드의 분자량과 이론적 등전점을 그 1글자 아미노산 서열로부터 계산하는 무료 브라우저 내 도구입니다. 서열을 붙여넣으면 달톤과 킬로달톤 단위 무게, 잔기 단위 길이, 추정 pI, 아미노산 조성을 반환합니다. 모든 계산은 브라우저에서 로컬로 이루어지며 서열은 절대 어디로도 전송되지 않습니다.
분자량은 20개 표준 평균 잔기 질량(예: Ala 71.08, Gly 57.05, Trp 186.21 Da)의 합에 자유 N-말단과 C-말단을 위한 물 18.02 Da를 더한 값입니다. 등전점은 이온화 가능한 기 — N-말단, C-말단, 그리고 Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys, Arg의 곁사슬 — 에 대해 Henderson–Hasselbalch 방정식으로 순전하를 pH의 함수로 쓴 다음, 표준 pKa 값을 사용해 순전하가 0을 지날 때까지 pH를 0과 14 사이에서 이분함으로써 구합니다.
양성 기(N-말단, His, Lys, Arg)는 1/(1+10^(pH−pKa))를 기여하고 음성 기(C-말단, Asp, Glu, Cys, Tyr)는 −1/(1+10^(pKa−pH))를 기여합니다. pI는 이론적 추정값이며, 실제 값은 온도, 이온 강도, 번역 후 변형에 따라 달라지고 이 서열 기반 방법은 이를 모델링하지 않습니다.
자주 묻는 질문
분자량은 어떻게 계산되나요?
서열에 있는 20개 아미노산의 평균 잔기 질량을 합하고 말단 물 18.02 Da를 더해 달톤 단위 평균 분자량을 구합니다. 1000으로 나누면 킬로달톤이 됩니다.
등전점은 어떻게 구하나요?
순전하를 표준 pKa 값을 사용해 이온화 가능한 기에 대한 Henderson–Hasselbalch 항의 합으로 쓴 다음, 순전하가 0이 되는 곳을 찾기 위해 pH를 0과 14 사이에서 이분합니다 — 그 pH가 pI입니다.
어떤 기가 pI에 영향을 주나요?
N-말단과 C-말단, 그리고 아스파르트산(D), 글루탐산(E), 시스테인(C), 티로신(Y), 히스티딘(H), 라이신(K), 아르기닌(R)의 곁사슬입니다. 이들의 개수와 pKa 값이 순전하가 0을 지나는 지점을 정합니다.
추정된 pI는 얼마나 정확한가요?
서열만으로부터 나온 이론값으로 보통 측정값의 pH 단위 몇 십분의 일 이내입니다. 3D 구조, 변형, 온도, 이온 강도를 무시하므로 참고 지침으로 취급하세요.