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Protein-Molekulargewicht- & pI-Rechner

Berechne das Molekulargewicht eines Proteins in Da/kDa und seinen isoelektrischen Punkt (pI) aus einer Ein-Buchstaben-Aminosäuresequenz.

Über dieses Tool

Der Protein-Molekulargewicht- & pI-Rechner ist ein kostenloses In-Browser-Werkzeug, das das Molekulargewicht und den theoretischen isoelektrischen Punkt eines Proteins oder Peptids aus seiner Ein-Buchstaben-Aminosäuresequenz berechnet. Füge die Sequenz ein und es gibt das Gewicht in Dalton und Kilodalton, die Länge in Resten, den geschätzten pI und die Aminosäurezusammensetzung zurück. Alle Berechnungen erfolgen lokal in deinem Browser und die Sequenz wird nie irgendwohin gesendet.

Das Molekulargewicht ist die Summe der 20 durchschnittlichen Standard-Restmassen (zum Beispiel Ala 71,08, Gly 57,05, Trp 186,21 Da) plus 18,02 Da Wasser für die freien N- und C-Termini. Der isoelektrische Punkt wird gefunden, indem die Nettoladung als Funktion des pH mit der Henderson-Hasselbalch-Gleichung über die ionisierbaren Gruppen geschrieben wird – der N-Terminus, C-Terminus und die Seitenketten von Asp, Glu, Cys, Tyr, His, Lys und Arg – unter Verwendung von Standard-pKa-Werten, dann wird der pH zwischen 0 und 14 bisektiert, bis die Nettoladung null durchläuft.

Positive Gruppen (N-Terminus, His, Lys, Arg) tragen 1/(1+10^(pH−pKa)) und negative Gruppen (C-Terminus, Asp, Glu, Cys, Tyr) tragen −1/(1+10^(pKa−pH)) bei. Der pI ist eine theoretische Schätzung; reale Werte verschieben sich mit Temperatur, Ionenstärke und posttranslationalen Modifikationen, die diese rein sequenzbasierte Methode nicht modelliert.

Häufig gestellte Fragen

Wie wird das Molekulargewicht berechnet?
Es summiert die durchschnittlichen Restmassen der 20 Aminosäuren in deiner Sequenz und addiert 18,02 Da für das terminale Wasser, was das durchschnittliche Molekulargewicht in Dalton ergibt; Division durch 1000 ergibt Kilodalton.
Wie wird der isoelektrische Punkt gefunden?
Die Nettoladung wird als Summe von Henderson-Hasselbalch-Termen über die ionisierbaren Gruppen unter Verwendung von Standard-pKa-Werten geschrieben, dann wird der pH zwischen 0 und 14 bisektiert, um zu finden, wo die Nettoladung null ist – dieser pH ist der pI.
Welche Gruppen beeinflussen den pI?
Der N-Terminus und C-Terminus plus die Seitenketten von Aspartat (D), Glutamat (E), Cystein (C), Tyrosin (Y), Histidin (H), Lysin (K) und Arginin (R). Ihre Anzahl und pKa-Werte bestimmen, wo die Nettoladung null durchläuft.
Wie genau ist der geschätzte pI?
Es ist ein theoretischer Wert allein aus der Sequenz und typischerweise innerhalb weniger Zehntel einer pH-Einheit von gemessenen Werten. Er ignoriert 3D-Struktur, Modifikationen, Temperatur und Ionenstärke, betrachte ihn also als Richtwert.

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