UTILS.
۱۰۰٪ در مرورگر
🧬

ماشین‌حساب وزن مولکولی DNA / الیگو

وزن مولکولی یک توالی DNA، dsDNA یا RNA را از ترکیب باز محاسبه کنید، همراه با طول، درصد GC و تبدیل nmol↔µg.

درباره این ابزار

ماشین‌حساب وزن مولکولی DNA / الیگو یک ابزار رایگان و درون‌مرورگری است که وزن مولکولی یک توالی اسید نوکلئیک را از ترکیب باز آن تخمین می‌زند. یک توالی DNA یا RNA را جای‌گذاری کنید، DNA تک‌رشته، DNA دورشته یا RNA را انتخاب کنید، و وزن مولکولی را به g/mol همراه با طول، محتوای GC، و یک تبدیل نانومول به میکروگرم برمی‌گرداند. توالی‌ها به‌صورت محلی در مرورگر شما پردازش می‌شوند و هرگز بارگذاری نمی‌شوند.

وزن برابر با مجموع جرم‌های بی‌آب مونوفسفات نوکلئوتیدی منهای یک تصحیح 61.96 g/mol برای حذف یک فسفات در انتهای ′۵ است. بازهای DNA از dA 313.21، dT 304.2، dC 289.18، dG 329.21 استفاده می‌کنند؛ RNA از A 329.21، U 306.17، C 305.18، G 345.21 استفاده می‌کند. برای DNA دورشته ابزار وزن رشته مکمل (A↔T، C↔G) را اضافه می‌کند بنابراین dsDNA ≈ ۲× رشته منفرد.

تبدیل‌های مقدار از µg = nmol × MW ÷ 1000 استفاده می‌کنند، و ابزار همچنین µg در هر nmol (MW ÷ 1000) را گزارش می‌دهد. این یک MW تقریبی مناسب برای سفارش و بازحل‌سازی الیگوها می‌دهد؛ فقط A، T/U، G و C را می‌شمارد، بنابراین کدهای ابهام یا اصلاحات لحاظ نمی‌شوند.

پرسش‌های پرتکرار

چه وزن‌هایی برای هر باز استفاده می‌شود؟
جرم‌های بی‌آب مونوفسفات: DNA dA 313.21، dT 304.2، dC 289.18، dG 329.21؛ RNA A 329.21، U 306.17، C 305.18، G 345.21 g/mol. سپس رشته جمع‌شده 61.96 برای تصحیح فسفات ′۵ کم می‌شود.
DNA دورشته چگونه مدیریت می‌شود؟
رشته مکمل با جفت‌شدن بازها (A↔T، C↔G) تولید می‌شود و وزن آن به رشته معنادار اضافه می‌شود، بنابراین وزن مولکولی dsDNA تقریباً دو برابر یک رشته منفرد با همان طول است.
چگونه بین nmol و µg تبدیل کنم؟
جرم به میکروگرم برابر با µg = nmol × MW ÷ 1000 است، و ماشین‌حساب همچنین µg در هر nmol را نشان می‌دهد، که برابر با MW ÷ 1000 است. مقدار را به نانومول وارد کنید تا جرم متناظر را ببینید.
آیا این یک وزن مولکولی دقیق است؟
این یک تقریب نزدیک با استفاده از جرم‌های باز استاندارد و تصحیح رایج فسفات 61.96 است که برای الیگوها و پرایمرها ایده‌آل است. اصلاحات شیمیایی، کدهای ابهام و شیمی انتهاها را نادیده می‌گیرد و فقط A، T/U، G و C را می‌شمارد.

ابزارهای بیشتر