このツールについて
DNA / オリゴ 分子量計算ツールは、核酸配列の分子量をその塩基組成から推定する、無料のブラウザ内ツールです。DNA または RNA 配列を貼り付け、一本鎖 DNA・二本鎖 DNA・RNA のいずれかを選ぶと、分子量を g/mol で、長さ・GC 含量・ナノモルからマイクログラムへの変換とともに返します。配列はブラウザ内でローカルに処理され、決してアップロードされません。
分子量は無水ヌクレオチド一リン酸質量の合計から、5′ 末端のリン酸除去のための 61.96 g/mol の補正を引いたものです。DNA 塩基は dA 313.21、dT 304.2、dC 289.18、dG 329.21 を、RNA は A 329.21、U 306.17、C 305.18、G 345.21 を使います。二本鎖 DNA では、ツールが相補鎖(A↔T, C↔G)の重量を加えるため、dsDNA ≈ 一本鎖の 2 倍になります。
量の変換は µg = nmol × MW ÷ 1000 を用い、ツールは nmol あたりの µg(MW ÷ 1000)も報告します。これはオリゴの発注や再懸濁に適したおおよその MW を与えます。A, T/U, G, C のみを数えるため、曖昧塩基コードや修飾は含まれません。
よくある質問
各塩基にはどの重量が使われますか?
無水一リン酸質量:DNA は dA 313.21、dT 304.2、dC 289.18、dG 329.21、RNA は A 329.21、U 306.17、C 305.18、G 345.21 g/mol です。合計した鎖から、5′ リン酸補正のため 61.96 が引かれます。
二本鎖 DNA はどのように扱われますか?
相補鎖が塩基対合(A↔T, C↔G)によって生成され、その重量がセンス鎖に加えられるため、dsDNA の分子量は同じ長さの一本鎖のおよそ 2 倍になります。
nmol と µg はどう変換しますか?
マイクログラム単位の質量は µg = nmol × MW ÷ 1000 で、計算ツールは nmol あたりの µg(MW ÷ 1000 に等しい)も表示します。量をナノモルで入力すると、対応する質量が表示されます。
これは正確な分子量ですか?
標準的な塩基質量と一般的な 61.96 リン酸補正を用いた近似で、オリゴやプライマーに最適です。化学修飾・曖昧塩基コード・末端の化学構造は無視し、A, T/U, G, C のみを数えます。