UTILS.
%100 tarayıcıda
🧬

DNA / Oligo Molekül Ağırlığı Hesaplayıcı

Bir DNA, dsDNA veya RNA dizisinin molekül ağırlığını baz bileşiminden hesaplayın; uzunluk, GC% ve nmol↔µg dönüşümü ile.

Bu araç hakkında

DNA / Oligo Molekül Ağırlığı Hesaplayıcı, bir nükleik asit dizisinin molekül ağırlığını baz bileşiminden tahmin eden ücretsiz, tarayıcı içi bir araçtır. Bir DNA veya RNA dizisi yapıştırın, tek iplikli DNA, çift iplikli DNA veya RNA seçin; g/mol cinsinden molekül ağırlığını, uzunluğu, GC içeriğini ve bir nanomol-mikrogram dönüşümünü döndürür. Diziler tarayıcınızda yerel olarak işlenir ve asla yüklenmez.

Ağırlık, 5′ ucundaki bir fosfatın kaldırılması için 61.96 g/mol'lük bir düzeltmenin çıkarıldığı susuz nükleotid monofosfat kütlelerinin toplamıdır. DNA bazları dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21 kullanır; RNA A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21 kullanır. Çift iplikli DNA için araç, tümleyici ipliğin ağırlığını (A↔T, C↔G) ekler, böylece dsDNA ≈ tek ipliğin 2 katıdır.

Miktar dönüşümleri µg = nmol × MW ÷ 1000 kullanır ve araç ayrıca nmol başına µg'yi (MW ÷ 1000) bildirir. Bu, oligoları sipariş etmek ve yeniden çözmek için uygun yaklaşık bir MW verir; yalnızca A, T/U, G ve C'yi sayar, bu yüzden belirsizlik kodları veya modifikasyonlar dâhil edilmez.

Sık sorulan sorular

Her baz için hangi ağırlıklar kullanılır?
Susuz monofosfat kütleleri: DNA dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21; RNA A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21 g/mol. Toplanan iplikten sonra 5′-fosfat düzeltmesi için 61.96 çıkarılır.
Çift iplikli DNA nasıl işlenir?
Tümleyici iplik baz eşleşmesiyle (A↔T, C↔G) üretilir ve ağırlığı anlamlı ipliğe eklenir, bu yüzden dsDNA molekül ağırlığı aynı uzunluktaki tek bir ipliğin kabaca iki katıdır.
Nmol ve µg arasında nasıl dönüştürürüm?
Mikrogram cinsinden kütle µg = nmol × MW ÷ 1000'dir ve hesaplayıcı ayrıca MW ÷ 1000'e eşit olan nmol başına µg'yi de gösterir. Karşılık gelen kütleyi görmek için miktarı nanomol cinsinden girin.
Bu tam bir molekül ağırlığı mı?
Standart baz kütleleri ve yaygın 61.96 fosfat düzeltmesini kullanan yakın bir yaklaşımdır; oligolar ve primerler için idealdir. Kimyasal modifikasyonları, belirsizlik kodlarını ve uç kimyalarını göz ardı eder ve yalnızca A, T/U, G ve C'yi sayar.

Daha fazla araç