Over deze tool
De DNA / Oligo Molecuulgewicht Calculator is een gratis, in-browser tool die het molecuulgewicht van een nucleïnezuursequentie schat op basis van de basensamenstelling. Plak een DNA- of RNA-sequentie, kies enkelstrengs DNA, dubbelstrengs DNA of RNA, en hij geeft het molecuulgewicht in g/mol terug samen met de lengte, het GC-gehalte en een nanomol-naar-microgram-conversie. Sequenties worden lokaal in je browser verwerkt en nooit geüpload.
Het gewicht is de som van de watervrije nucleotidemonofosfaatmassa's minus een correctie van 61,96 g/mol voor de verwijdering van een fosfaat aan het 5′-uiteinde. DNA-basen gebruiken dA 313,21, dT 304,2, dC 289,18, dG 329,21; RNA gebruikt A 329,21, U 306,17, C 305,18, G 345,21. Voor dubbelstrengs DNA voegt de tool het gewicht van de complementaire streng toe (A↔T, C↔G), zodat dsDNA ≈ 2× de enkele streng.
Hoeveelheidsconversies gebruiken µg = nmol × MW ÷ 1000, en de tool rapporteert ook µg per nmol (MW ÷ 1000). Dit geeft een benaderd MW dat geschikt is voor het bestellen en resuspenderen van oligo's; het telt alleen A, T/U, G en C, dus ambiguïteitscodes of modificaties zijn niet inbegrepen.