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Calcolatore del peso molecolare di DNA / oligo

Calcola il peso molecolare di una sequenza di DNA, dsDNA o RNA dalla composizione in basi, con lunghezza, GC% e conversione nmol↔µg.

Informazioni su questo strumento

Il Calcolatore del peso molecolare di DNA / oligo è uno strumento gratuito, in-browser, che stima il peso molecolare di una sequenza di acido nucleico dalla sua composizione in basi. Incolla una sequenza di DNA o RNA, scegli DNA a singolo filamento, DNA a doppio filamento o RNA, e restituisce il peso molecolare in g/mol insieme alla lunghezza, al contenuto in GC e a una conversione da nanomole a microgrammo. Le sequenze vengono elaborate localmente nel tuo browser e mai caricate.

Il peso è la somma delle masse anidre dei nucleotidi monofosfato meno una correzione di 61,96 g/mol per la rimozione di un fosfato all'estremità 5′. Le basi del DNA usano dA 313,21, dT 304,2, dC 289,18, dG 329,21; l'RNA usa A 329,21, U 306,17, C 305,18, G 345,21. Per il DNA a doppio filamento lo strumento aggiunge il peso del filamento complementare (A↔T, C↔G) quindi il dsDNA ≈ 2× il singolo filamento.

Le conversioni di quantità usano µg = nmol × MW ÷ 1000, e lo strumento riporta anche i µg per nmol (MW ÷ 1000). Questo dà un MW approssimato adatto per ordinare e risospendere gli oligo; conta solo A, T/U, G e C, quindi i codici di ambiguità o le modifiche non sono inclusi.

Domande frequenti

Quali pesi vengono usati per ciascuna base?
Masse anidre del monofosfato: DNA dA 313,21, dT 304,2, dC 289,18, dG 329,21; RNA A 329,21, U 306,17, C 305,18, G 345,21 g/mol. Al filamento sommato vengono poi sottratti 61,96 per la correzione del 5′-fosfato.
Come viene gestito il DNA a doppio filamento?
Il filamento complementare viene generato per appaiamento delle basi (A↔T, C↔G) e il suo peso viene aggiunto al filamento senso, quindi il peso molecolare del dsDNA è circa il doppio di un singolo filamento della stessa lunghezza.
Come converto tra nmol e µg?
La massa in microgrammi è µg = nmol × MW ÷ 1000, e il calcolatore mostra anche i µg per nmol, che equivale a MW ÷ 1000. Inserisci la quantità in nanomoli per vedere la massa corrispondente.
Questo è un peso molecolare esatto?
È un'approssimazione accurata che usa masse standard delle basi e la comune correzione di 61,96 per il fosfato, ideale per oligo e primer. Ignora le modifiche chimiche, i codici di ambiguità e le chimiche terminali, e conta solo A, T/U, G e C.

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