UTILS.
ทำงานในเบราว์เซอร์ 100%
🧬

เครื่องคำนวณน้ำหนักโมเลกุล DNA / โอลิโก

คำนวณน้ำหนักโมเลกุลของลำดับ DNA, dsDNA หรือ RNA จากองค์ประกอบเบส พร้อมความยาว GC% และการแปลง nmol↔µg

เกี่ยวกับเครื่องมือนี้

เครื่องคำนวณน้ำหนักโมเลกุล DNA / โอลิโก เป็นเครื่องมือฟรีที่ทำงานในเบราว์เซอร์ ซึ่งประมาณน้ำหนักโมเลกุลของลำดับกรดนิวคลีอิกจากองค์ประกอบเบสของมัน วางลำดับ DNA หรือ RNA เลือก DNA สายเดี่ยว DNA สายคู่ หรือ RNA แล้วมันจะคืนน้ำหนักโมเลกุลเป็น g/mol พร้อมความยาว ปริมาณ GC และการแปลงนาโนโมลเป็นไมโครกรัม ลำดับจะถูกประมวลผลในเบราว์เซอร์ของคุณและไม่เคยถูกอัปโหลด

น้ำหนักคือผลรวมของมวลนิวคลีโอไทด์โมโนฟอสเฟตแบบไร้น้ำลบด้วยการแก้ไข 61.96 g/mol สำหรับการเอาฟอสเฟตออกที่ปลาย 5′ เบส DNA ใช้ dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21 ส่วน RNA ใช้ A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21 สำหรับ DNA สายคู่ เครื่องมือจะเพิ่มน้ำหนักของสายคู่เติมเต็ม (A↔T, C↔G) ดังนั้น dsDNA ≈ 2 เท่าของสายเดี่ยว

การแปลงปริมาณใช้ µg = nmol × MW ÷ 1000 และเครื่องมือยังรายงาน µg ต่อ nmol (MW ÷ 1000) ด้วย ซึ่งให้ค่า MW โดยประมาณที่เหมาะสำหรับการสั่งซื้อและละลายโอลิโก มันนับเฉพาะ A, T/U, G และ C ดังนั้นรหัสความกำกวมหรือการดัดแปลงจะไม่รวมอยู่ด้วย

คำถามที่พบบ่อย

ใช้น้ำหนักใดสำหรับแต่ละเบส?
มวลโมโนฟอสเฟตแบบไร้น้ำ: DNA dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21 ส่วน RNA A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21 g/mol จากนั้นสายที่รวมแล้วจะถูกลบ 61.96 สำหรับการแก้ไขฟอสเฟตที่ปลาย 5′
DNA สายคู่จัดการอย่างไร?
สายคู่เติมเต็มถูกสร้างขึ้นโดยการจับคู่เบส (A↔T, C↔G) และน้ำหนักของมันถูกเพิ่มเข้ากับสาย sense ดังนั้นน้ำหนักโมเลกุลของ dsDNA จึงประมาณสองเท่าของสายเดี่ยวที่มีความยาวเท่ากัน
ฉันแปลงระหว่าง nmol และ µg อย่างไร?
มวลเป็นไมโครกรัมคือ µg = nmol × MW ÷ 1000 และเครื่องคำนวณยังแสดง µg ต่อ nmol ซึ่งเท่ากับ MW ÷ 1000 ป้อนปริมาณเป็นนาโนโมลเพื่อดูมวลที่สอดคล้องกัน
นี่เป็นน้ำหนักโมเลกุลที่แน่นอนหรือไม่?
มันเป็นค่าประมาณที่ใกล้เคียงโดยใช้มวลเบสมาตรฐานและการแก้ไขฟอสเฟต 61.96 ทั่วไป เหมาะสำหรับโอลิโกและไพรเมอร์ มันละเว้นการดัดแปลงทางเคมี รหัสความกำกวม และเคมีของปลายสาย และนับเฉพาะ A, T/U, G และ C

เครื่องมือเพิ่มเติม