UTILS.
100% trong trình duyệt
🧬

Máy tính khối lượng phân tử DNA / Oligo

Tính khối lượng phân tử của một trình tự DNA, dsDNA hoặc RNA từ thành phần base, với chiều dài, GC% và chuyển đổi nmol↔µg.

Về công cụ này

Máy tính khối lượng phân tử DNA / Oligo là một công cụ miễn phí, chạy trong trình duyệt ước tính khối lượng phân tử của một trình tự axit nucleic từ thành phần base của nó. Dán một trình tự DNA hoặc RNA, chọn DNA mạch đơn, DNA mạch kép, hoặc RNA, và nó trả về khối lượng phân tử tính bằng g/mol cùng với chiều dài, hàm lượng GC, và chuyển đổi nanomol sang microgram. Các trình tự được xử lý cục bộ trong trình duyệt của bạn và không bao giờ được tải lên.

Khối lượng là tổng khối lượng nucleotide monophosphate khan trừ đi hiệu chỉnh 61.96 g/mol cho việc loại bỏ một phosphate ở đầu 5′. Base DNA dùng dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21; RNA dùng A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21. Với DNA mạch kép công cụ cộng khối lượng của mạch bổ sung (A↔T, C↔G) nên dsDNA ≈ 2× mạch đơn.

Các chuyển đổi lượng dùng µg = nmol × MW ÷ 1000, và công cụ cũng báo cáo µg trên nmol (MW ÷ 1000). Điều này cho một MW xấp xỉ phù hợp để đặt hàng và hòa lại oligo; nó chỉ đếm A, T/U, G và C, nên các mã nhập nhằng hoặc biến đổi không được tính vào.

Câu hỏi thường gặp

Khối lượng nào được dùng cho mỗi base?
Khối lượng monophosphate khan: DNA dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21; RNA A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21 g/mol. Mạch đã cộng sau đó bị trừ 61.96 cho hiệu chỉnh phosphate 5′.
DNA mạch kép được xử lý thế nào?
Mạch bổ sung được tạo ra bằng bắt cặp base (A↔T, C↔G) và khối lượng của nó được cộng vào mạch nghĩa, nên khối lượng phân tử dsDNA khoảng gấp đôi một mạch đơn cùng chiều dài.
Tôi chuyển đổi giữa nmol và µg thế nào?
Khối lượng tính bằng microgram là µg = nmol × MW ÷ 1000, và máy tính cũng hiển thị µg trên nmol, bằng MW ÷ 1000. Nhập lượng tính bằng nanomol để thấy khối lượng tương ứng.
Đây có phải khối lượng phân tử chính xác không?
Đó là một xấp xỉ gần đúng dùng khối lượng base tiêu chuẩn và hiệu chỉnh phosphate 61.96 thông dụng, lý tưởng cho oligo và mồi. Nó bỏ qua các biến đổi hóa học, mã nhập nhằng và hóa học đầu mạch, và chỉ đếm A, T/U, G và C.

Công cụ khác