Về công cụ này
Nhập một trình tự mồi để ước tính nhiệt độ nóng chảy (Tm) của nó, nhiệt độ mà một nửa mạch kép trở thành mạch đơn. Trình tự được viết hoa và rút gọn về A, C, G, T và U trước khi đếm các base. Mọi thứ được tính trong trình duyệt của bạn.
Phương pháp cơ bản dùng quy tắc Wallace cho mồi ngắn (dưới 14 nucleotide): Tm = 2 × (A + T) + 4 × (G + C). Với mồi từ 14 base trở lên nó chuyển sang công thức dựa trên GC Tm = 64.9 + 41 × (GC − 16.4) / chiều dài. Phương pháp hiệu chỉnh muối áp dụng Tm = 81.5 + 0.41 × GC% − 675 / chiều dài + 16.6 × log10([Na⁺]), trong đó nồng độ natri được nhập theo millimolar, để tính đến điều kiện đệm.
Một nhiệt độ gắn mồi gợi ý khoảng Tm − 5 °C được cung cấp làm điểm khởi đầu thực tế cho PCR, cùng với GC% và chiều dài của mồi. Ví dụ, mồi 8-mer ATGCATGC (4 A/T và 4 G/C) cho Tm Wallace là 2×4 + 4×4 = 24 °C.