इस टूल के बारे में
इसके गलनांक तापमान (Tm) का अनुमान लगाने के लिए एक प्राइमर अनुक्रम दर्ज करें, वह तापमान जिस पर द्विकुंडली का आधा भाग एकल-स्ट्रैंड होता है। बेस गिने जाने से पहले अनुक्रम को बड़े अक्षरों में बदला जाता है और A, C, G, T और U तक घटाया जाता है। सब कुछ आपके ब्राउज़र में गणना किया जाता है।
मूल विधि छोटे प्राइमरों (14 न्यूक्लियोटाइड से कम) के लिए Wallace नियम का उपयोग करती है: Tm = 2 × (A + T) + 4 × (G + C)। 14 बेस या उससे अधिक के प्राइमरों के लिए यह GC-आधारित सूत्र Tm = 64.9 + 41 × (GC − 16.4) / लंबाई पर बदल जाती है। नमक-समायोजित विधि Tm = 81.5 + 0.41 × GC% − 675 / लंबाई + 16.6 × log10([Na⁺]) लागू करती है, जहाँ सोडियम सांद्रता मिलीमोलर में दर्ज की जाती है, बफर परिस्थितियों को ध्यान में रखने के लिए।
लगभग Tm − 5 °C का एक सुझाया गया एनीलिंग तापमान PCR के लिए एक व्यावहारिक शुरुआती बिंदु के रूप में दिया जाता है, साथ ही प्राइमर का GC% और लंबाई। उदाहरण के लिए, 8-मर ATGCATGC (4 A/T और 4 G/C) 2×4 + 4×4 = 24 °C का Wallace Tm देता है।