UTILS.
100% w przeglądarce
🧬

Kalkulator masy cząsteczkowej DNA / oligo

Oblicz masę cząsteczkową sekwencji DNA, dsDNA lub RNA ze składu zasad, z długością, GC% i konwersją nmol↔µg.

O tym narzędziu

Kalkulator masy cząsteczkowej DNA / oligo to darmowe narzędzie działające w przeglądarce, które szacuje masę cząsteczkową sekwencji kwasu nukleinowego z jej składu zasad. Wklej sekwencję DNA lub RNA, wybierz jednoniciowe DNA, dwuniciowe DNA lub RNA, a zwróci masę cząsteczkową w g/mol wraz z długością, zawartością GC i konwersją z nanomoli na mikrogramy. Sekwencje są przetwarzane lokalnie w Twojej przeglądarce i nigdy nie są przesyłane.

Masa to suma bezwodnych mas monofosforanów nukleotydów pomniejszona o korektę 61.96 g/mol za usunięcie fosforanu na końcu 5′. Zasady DNA używają dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21; RNA używa A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21. Dla dwuniciowego DNA narzędzie dodaje masę nici komplementarnej (A↔T, C↔G), więc dsDNA ≈ 2× nić pojedyncza.

Konwersje ilości używają µg = nmol × MW ÷ 1000, a narzędzie podaje również µg na nmol (MW ÷ 1000). Daje to przybliżoną MW odpowiednią do zamawiania i rozpuszczania oligonukleotydów; liczy tylko A, T/U, G i C, więc kody niejednoznaczności ani modyfikacje nie są uwzględniane.

Najczęściej zadawane pytania

Jakie masy są używane dla każdej zasady?
Bezwodne masy monofosforanów: DNA dA 313.21, dT 304.2, dC 289.18, dG 329.21; RNA A 329.21, U 306.17, C 305.18, G 345.21 g/mol. Od zsumowanej nici odejmowane jest następnie 61.96 jako korekta fosforanu 5′.
Jak obsługiwane jest dwuniciowe DNA?
Nić komplementarna jest generowana przez parowanie zasad (A↔T, C↔G), a jej masa jest dodawana do nici sensownej, więc masa cząsteczkowa dsDNA to mniej więcej dwukrotność pojedynczej nici tej samej długości.
Jak przeliczyć między nmol a µg?
Masa w mikrogramach to µg = nmol × MW ÷ 1000, a kalkulator pokazuje również µg na nmol, co równa się MW ÷ 1000. Wprowadź ilość w nanomolach, aby zobaczyć odpowiadającą masę.
Czy to dokładna masa cząsteczkowa?
To bliskie przybliżenie przy użyciu standardowych mas zasad i powszechnej korekty fosforanu 61.96, idealne dla oligonukleotydów i starterów. Ignoruje modyfikacje chemiczne, kody niejednoznaczności i chemię końców oraz liczy tylko A, T/U, G i C.

Więcej narzędzi