UTILS.
100% w przeglądarce
🔤

Translator kodon → aminokwas

Przetłumacz sekwencję DNA lub RNA na białko za pomocą standardowego kodu genetycznego, z ramką odczytu, kodonem start i wynikiem 1- lub 3-literowym.

wynik

O tym narzędziu

Wprowadź sekwencję DNA lub RNA, a to narzędzie przetłumaczy ją na odpowiednie białko za pomocą standardowego kodu genetycznego. Każde T jest traktowane jako U, a znaki niebędące nukleotydami są usuwane, więc możesz wkleić surowe lub sformatowane sekwencje. Praca odbywa się całkowicie w Twojej przeglądarce.

Tłumaczenie zaczyna się od ramki odczytu 1, 2 lub 3 (przesunięcie o 0, 1 lub 2 zasady). Sekwencja jest następnie odczytywana po trzy zasady naraz; każdy z 64 kodonów odpowiada jednemu aminokwasowi lub sygnałowi stop (UAA, UAG, UGA). Opcjonalnie tłumaczenie może rozpocząć się od pierwszego kodonu start AUG i zawsze zatrzymuje się na pierwszym kodonie stop. Końcowa grupa jednej lub dwóch pozostałych zasad jest zgłaszana jako niekompletny końcowy kodon.

Białko jest pokazywane w kodzie jednoliterowym lub trzyliterowym, zależnie od wyboru, i można je skopiować. Na przykład AUG UUU UAA tłumaczy się na Met-Phe-Stop, tj. peptyd MF, po którym następuje stop przy kodonie 3.

Najczęściej zadawane pytania

Jaki kod genetyczny jest używany?
Standardowy (jądrowy) kod genetyczny, z 61 kodonami sensownymi plus trzema kodonami stop UAA, UAG i UGA. Alternatywne kody mitochondrialne lub bakteryjne nie są stosowane.
Co robi ramka odczytu?
Ramka 1 zaczyna się od pierwszej zasady, ramka 2 pomija jedną zasadę, a ramka 3 pomija dwie. Przesunięcie ramki zmienia sposób grupowania sekwencji w tryplety, a więc i produkowane białko.
Czym jest opcja „start od pierwszego AUG”?
Gdy jest włączona, tłumaczenie ignoruje wszystko przed pierwszym kodonem AUG w wybranej ramce i zaczyna się tam od metioniny — przydatne do znajdowania otwartej ramki odczytu.
Co dzieje się z pozostałą zasadą na końcu?
Jeśli długość sekwencji nie jest wielokrotnością trzech, jedna lub dwie końcowe zasady nie mogą utworzyć kodonu; są pomijane i zgłaszane jako niekompletny końcowy kodon.

Więcej narzędzi