UTILS.
100% у браузері
🔤

Транслятор кодон → амінокислота

Транслюйте послідовність DNA або RNA в білок за стандартним генетичним кодом, з рамкою зчитування, старт-кодоном і виводом у 1- чи 3-буквеному коді.

результат

Про цей інструмент

Введіть послідовність DNA або RNA, і цей інструмент транслює її у відповідний білок за стандартним генетичним кодом. Будь-який T трактується як U, а не-нуклеотидні символи видаляються, тож ви можете вставляти необроблені або форматовані послідовності. Робота виконується повністю у вашому браузері.

Трансляція починається з рамки зчитування 1, 2 або 3 (зсув на 0, 1 або 2 основи). Потім послідовність зчитується по три основи за раз; кожен із 64 кодонів відповідає одній амінокислоті або стоп-сигналу (UAA, UAG, UGA). За бажанням трансляцію можна почати з першого старт-кодону AUG, і вона завжди зупиняється на першому стоп-кодоні. Кінцева група з однієї чи двох залишкових основ повідомляється як неповний фінальний кодон.

Білок показується в одно- або трибуквеному коді, залежно від вашого вибору, і його можна скопіювати. Наприклад, AUG UUU UAA транслюється в Met-Phe-Stop, тобто пептид MF, за яким слідує стоп на кодоні 3.

Поширені запитання

Який генетичний код використовується?
Стандартний (ядерний) генетичний код, з 61 змістовим кодоном плюс три стоп-кодони UAA, UAG і UGA. Альтернативні мітохондріальні чи бактеріальні коди не застосовуються.
Що робить рамка зчитування?
Рамка 1 починається з першої основи, рамка 2 пропускає одну основу, а рамка 3 пропускає дві. Зсув рамки змінює те, як послідовність групується в триплети, і, відповідно, отриманий білок.
Що таке опція «почати з першого AUG»?
Коли її увімкнено, трансляція ігнорує все до першого кодону AUG у вибраній рамці та починається там з метіоніну — корисно для пошуку відкритої рамки зчитування.
Що відбувається із залишковою основою в кінці?
Якщо довжина послідовності не кратна трьом, одна чи дві кінцеві основи не можуть утворити кодон; вони пропускаються і повідомляються як неповний фінальний кодон.

Більше інструментів