Penerjemah Kodon → Asam Amino

Tentang alat ini

Masukkan sekuens DNA atau RNA dan alat ini menerjemahkannya menjadi protein yang sesuai menggunakan kode genetik standar. Setiap T diperlakukan sebagai U, dan karakter non-nukleotida dihapus, sehingga Anda dapat menempelkan sekuens mentah atau berformat. Pekerjaan dilakukan sepenuhnya di peramban Anda.

Translasi dimulai pada kerangka baca 1, 2 atau 3 (offset 0, 1 atau 2 basa). Sekuens kemudian dibaca tiga basa sekaligus; masing-masing dari 64 kodon dipetakan ke satu asam amino atau sinyal stop (UAA, UAG, UGA). Secara opsional, translasi dapat dimulai pada kodon awal AUG pertama dan selalu berhenti pada kodon stop pertama. Kelompok sisa satu atau dua basa di akhir dilaporkan sebagai kodon akhir yang tidak lengkap.

Protein ditampilkan dalam kode satu huruf atau tiga huruf, mana pun yang Anda pilih, dan dapat disalin. Misalnya AUG UUU UAA diterjemahkan menjadi Met-Phe-Stop, yaitu peptida MF diikuti oleh stop pada kodon 3.

Pertanyaan yang sering diajukan

Kode genetik apa yang digunakan?

Kode genetik standar (inti), dengan 61 kodon sense ditambah tiga kodon stop UAA, UAG dan UGA. Kode mitokondria atau bakteri alternatif tidak diterapkan.

Apa fungsi kerangka baca?

Kerangka 1 dimulai pada basa pertama, kerangka 2 melewati satu basa dan kerangka 3 melewati dua basa. Menggeser kerangka mengubah cara sekuens dikelompokkan menjadi triplet dan karenanya protein yang dihasilkan.

Apa opsi 'mulai pada AUG pertama'?

Saat diaktifkan, translasi mengabaikan segala sesuatu sebelum kodon AUG pertama dalam kerangka yang dipilih dan dimulai di sana dengan metionina — berguna untuk menemukan kerangka baca terbuka.

Apa yang terjadi pada basa sisa di akhir?

Jika panjang sekuens bukan kelipatan tiga, satu atau dua basa sisa di akhir tidak dapat membentuk kodon; basa itu dilewati dan dilaporkan sebagai kodon akhir yang tidak lengkap.

Tentang alat ini

Pertanyaan yang sering diajukan

Alat lainnya