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Codon → Aminosäure-Übersetzer

Übersetze eine DNA- oder RNA-Sequenz mit dem Standard-Gencode in ein Protein, mit Leseraster, Startcodon und 1- oder 3-Buchstaben-Ausgabe.

Ausgabe

Über dieses Tool

Gib eine DNA- oder RNA-Sequenz ein und dieses Werkzeug übersetzt sie mit dem Standard-Gencode in das entsprechende Protein. Jedes T wird als U behandelt und Nicht-Nukleotid-Zeichen werden entfernt, sodass du rohe oder formatierte Sequenzen einfügen kannst. Die Arbeit erfolgt vollständig in deinem Browser.

Die Übersetzung beginnt im Leseraster 1, 2 oder 3 (ein Versatz von 0, 1 oder 2 Basen). Die Sequenz wird dann in Dreiergruppen gelesen; jedes der 64 Codons wird auf eine Aminosäure oder ein Stoppsignal (UAA, UAG, UGA) abgebildet. Optional kann die Übersetzung beim ersten AUG-Startcodon beginnen und hält stets beim ersten Stoppcodon an. Eine übrig gebliebene Gruppe von einer oder zwei Restbasen wird als unvollständiges letztes Codon gemeldet.

Das Protein wird im Ein-Buchstaben- oder Drei-Buchstaben-Code angezeigt, je nach Wahl, und ist kopierbar. Zum Beispiel wird AUG UUU UAA zu Met-Phe-Stopp übersetzt, also das Peptid MF gefolgt von einem Stopp am Codon 3.

Häufig gestellte Fragen

Welcher Gencode wird verwendet?
Der Standard-Gencode (Zellkern) mit 61 Sinn-Codons plus den drei Stoppcodons UAA, UAG und UGA. Alternative mitochondriale oder bakterielle Codes werden nicht angewendet.
Was bewirkt das Leseraster?
Raster 1 beginnt bei der ersten Base, Raster 2 überspringt eine Base und Raster 3 überspringt zwei. Das Verschieben des Rasters ändert, wie die Sequenz in Tripletts gruppiert wird und damit das erzeugte Protein.
Was ist die Option „Beim ersten AUG starten“?
Wenn aktiviert, ignoriert die Übersetzung alles vor dem ersten AUG-Codon im gewählten Raster und beginnt dort mit Methionin – nützlich zum Finden eines offenen Leserasters.
Was passiert mit einer Restbase am Ende?
Wenn die Sequenzlänge kein Vielfaches von drei ist, können die ein oder zwei letzten Basen kein Codon bilden; sie werden übersprungen und als unvollständiges letztes Codon gemeldet.

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