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🔤

コドン → アミノ酸 翻訳ツール

標準遺伝暗号を用いて DNA または RNA 配列をタンパク質に翻訳し、読み枠・開始コドン・1文字または3文字表記で出力します。

出力

このツールについて

DNA または RNA 配列を入力すると、このツールが標準遺伝暗号を用いて対応するタンパク質に翻訳します。T はすべて U として扱われ、ヌクレオチド以外の文字は除去されるため、生の配列や整形された配列を貼り付けられます。処理はすべてブラウザ内で行われます。

翻訳は読み枠 1、2、または 3(0、1、または 2 塩基のオフセット)から始まります。次に配列は3塩基ずつ読み取られ、64 のコドンそれぞれが1つのアミノ酸または終止シグナル(UAA, UAG, UGA)に対応します。オプションで最初の AUG 開始コドンから翻訳を始めることができ、常に最初の終止コドンで停止します。末尾に残った1つまたは2つの塩基は、不完全な末尾コドンとして報告されます。

タンパク質は選択に応じて1文字または3文字表記で表示され、コピー可能です。例えば AUG UUU UAA は Met-Phe-Stop に翻訳され、すなわちペプチド MF の後にコドン3で終止します。

よくある質問

どの遺伝暗号が使われますか?
標準(核)遺伝暗号で、61 のセンスコドンと3つの終止コドン UAA, UAG, UGA を用います。ミトコンドリアや細菌の代替暗号は適用されません。
読み枠は何をしますか?
枠1は最初の塩基から始まり、枠2は1塩基、枠3は2塩基スキップします。枠を変えると配列が三つ組にグループ化される仕方が変わり、したがって生成されるタンパク質も変わります。
「最初の AUG から開始」オプションとは何ですか?
有効にすると、選択した枠内で最初の AUG コドンより前をすべて無視し、そこからメチオニンで始めます。オープンリーディングフレームを見つけるのに便利です。
末尾に残った塩基はどうなりますか?
配列の長さが3の倍数でない場合、末尾の1つまたは2つの塩基はコドンを形成できません。それらはスキップされ、不完全な末尾コドンとして報告されます。

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