UTILS.
۱۰۰٪ در مرورگر
🔤

مترجم کدون → آمینواسید

یک توالی DNA یا RNA را با استفاده از کد ژنتیکی استاندارد به پروتئین ترجمه کنید، همراه با چارچوب خواندن، کدون آغاز و خروجی ۱ یا ۳ حرفی.

خروجی

درباره این ابزار

یک توالی DNA یا RNA وارد کنید و این ابزار آن را با استفاده از کد ژنتیکی استاندارد به پروتئین متناظر ترجمه می‌کند. هر T به‌عنوان U در نظر گرفته می‌شود و کاراکترهای غیرنوکلئوتیدی حذف می‌شوند، بنابراین می‌توانید توالی‌های خام یا قالب‌بندی‌شده را جای‌گذاری کنید. کار به‌طور کامل در مرورگر شما انجام می‌شود.

ترجمه از چارچوب خواندن ۱، ۲ یا ۳ (آفست ۰، ۱ یا ۲ باز) آغاز می‌شود. سپس توالی سه باز در هر بار خوانده می‌شود؛ هر یک از ۶۴ کدون به یک آمینواسید یا یک سیگنال پایان (UAA، UAG، UGA) نگاشت می‌شود. به‌صورت اختیاری، ترجمه می‌تواند از اولین کدون آغاز AUG شروع شود و همیشه در اولین کدون پایان متوقف می‌شود. گروهی از یک یا دو باز باقی‌مانده در انتها به‌عنوان کدون پایانی ناقص گزارش می‌شود.

پروتئین به کد تک‌حرفی یا سه‌حرفی، هر کدام که انتخاب کنید، نمایش داده می‌شود و قابل کپی است. برای مثال AUG UUU UAA به Met-Phe-Stop ترجمه می‌شود، یعنی پپتید MF و به‌دنبال آن یک پایان در کدون ۳.

پرسش‌های پرتکرار

از کدام کد ژنتیکی استفاده می‌شود؟
کد ژنتیکی استاندارد (هسته‌ای)، با ۶۱ کدون معنادار به‌علاوه سه کدون پایان UAA، UAG و UGA. کدهای جایگزین میتوکندریایی یا باکتریایی اعمال نمی‌شوند.
چارچوب خواندن چه می‌کند؟
چارچوب ۱ از اولین باز آغاز می‌شود، چارچوب ۲ یک باز را رد می‌کند و چارچوب ۳ دو باز را رد می‌کند. تغییر چارچوب نحوه گروه‌بندی توالی به سه‌تایی‌ها و در نتیجه پروتئین تولیدشده را تغییر می‌دهد.
گزینه «آغاز از اولین AUG» چیست؟
وقتی فعال باشد، ترجمه هر چیزی را پیش از اولین کدون AUG در چارچوب انتخاب‌شده نادیده می‌گیرد و از آنجا با متیونین آغاز می‌شود — برای یافتن یک چارچوب خواندن باز مفید است.
با یک باز باقی‌مانده در انتها چه می‌شود؟
اگر طول توالی مضربی از سه نباشد، یک یا دو باز انتهایی نمی‌توانند یک کدون تشکیل دهند؛ آن‌ها رد شده و به‌عنوان کدون پایانی ناقص گزارش می‌شوند.

ابزارهای بیشتر