UTILS.
‎100%‎ داخل المتصفح
🔤

مترجم الكودون → الحمض الأميني

ترجم تسلسل DNA أو RNA إلى بروتين باستخدام الشيفرة الوراثية القياسية، مع إطار القراءة وكودون البدء ومخرَج بحرف واحد أو ثلاثة أحرف.

المخرج

حول هذه الأداة

أدخل تسلسل DNA أو RNA وتقوم هذه الأداة بترجمته إلى البروتين المقابل باستخدام الشيفرة الوراثية القياسية. يُعامَل أي T كأنه U، وتُزال الأحرف غير النيوكليوتيدية، بحيث يمكنك لصق تسلسلات خام أو منسَّقة. يجري العمل بالكامل داخل متصفحك.

تبدأ الترجمة عند إطار القراءة 1 أو 2 أو 3 (بإزاحة قدرها 0 أو 1 أو 2 قاعدة). ثم يُقرأ التسلسل ثلاث قواعد في كل مرة؛ ويرتبط كل كودون من الكودونات الـ 64 بحمض أميني واحد أو بإشارة توقف (UAA أو UAG أو UGA). يمكن اختيارياً أن تبدأ الترجمة عند أول كودون بدء AUG وهي تتوقف دائماً عند أول كودون توقف. أما مجموعة متبقية من قاعدة أو قاعدتين في النهاية فتُبلَّغ ككودون نهائي غير مكتمل.

يُعرَض البروتين بشيفرة الحرف الواحد أو الثلاثة أحرف، أيهما تختار، ويكون قابلاً للنسخ. على سبيل المثال يترجَم AUG UUU UAA إلى Met-Phe-Stop، أي الببتيد MF متبوعاً بتوقف عند الكودون 3.

الأسئلة الشائعة

ما الشيفرة الوراثية المستخدمة؟
الشيفرة الوراثية القياسية (النووية)، مع 61 كودوناً حسّياً بالإضافة إلى كودونات التوقف الثلاثة UAA و UAG و UGA. أما الشيفرات الميتوكوندرية أو البكتيرية البديلة فلا تُطبَّق.
ماذا يفعل إطار القراءة؟
يبدأ الإطار 1 عند القاعدة الأولى، ويتخطى الإطار 2 قاعدة واحدة، ويتخطى الإطار 3 قاعدتين. يغيِّر إزاحة الإطار طريقة تجميع التسلسل إلى ثلاثيات وبالتالي البروتين الناتج.
ما خيار «البدء عند أول AUG»؟
عند تفعيله، تتجاهل الترجمة كل ما قبل أول كودون AUG في الإطار المختار وتبدأ عنده بالميثيونين — وهو مفيد لإيجاد إطار قراءة مفتوح.
ماذا يحدث لقاعدة متبقية في النهاية؟
إذا لم يكن طول التسلسل من مضاعفات الثلاثة، فإن القاعدة أو القاعدتين المتبقيتين لا تستطيعان تكوين كودون؛ تُتخطَّيان وتُبلَّغان ككودون نهائي غير مكتمل.

المزيد من الأدوات