UTILS.
100% в браузере
🔤

Транслятор кодонов в аминокислоты

Транслируйте последовательность ДНК или РНК в белок по стандартному генетическому коду с рамкой считывания, старт-кодоном и выводом в 1 или 3 буквы.

результат

Об этом инструменте

Введите последовательность ДНК или РНК, и этот инструмент транслирует её в соответствующий белок по стандартному генетическому коду. Любой T рассматривается как U, а не-нуклеотидные символы удаляются, поэтому вы можете вставлять как сырые, так и отформатированные последовательности. Вся работа выполняется полностью в вашем браузере.

Трансляция начинается с рамки считывания 1, 2 или 3 (сдвиг на 0, 1 или 2 основания). Затем последовательность читается по три основания за раз; каждый из 64 кодонов соответствует одной аминокислоте или стоп-сигналу (UAA, UAG, UGA). При желании трансляция может начинаться с первого старт-кодона AUG и всегда останавливается на первом стоп-кодоне. Оставшаяся группа из одного или двух лишних оснований сообщается как неполный последний кодон.

Белок показывается в однобуквенном или трёхбуквенном коде — по вашему выбору — и его можно скопировать. Например, AUG UUU UAA транслируется в Met-Phe-Stop, то есть пептид MF, за которым следует стоп на кодоне 3.

Часто задаваемые вопросы

Какой генетический код используется?
Стандартный (ядерный) генетический код с 61 смысловым кодоном плюс три стоп-кодона UAA, UAG и UGA. Альтернативные митохондриальные или бактериальные коды не применяются.
Что делает рамка считывания?
Рамка 1 начинается с первого основания, рамка 2 пропускает одно основание, а рамка 3 пропускает два. Сдвиг рамки меняет группировку последовательности на триплеты и, следовательно, получаемый белок.
Что означает опция «начинать с первого AUG»?
Когда она включена, трансляция игнорирует всё до первого кодона AUG в выбранной рамке и начинается с него с метионина — полезно для поиска открытой рамки считывания.
Что происходит с оставшимся основанием в конце?
Если длина последовательности не кратна трём, одно или два последних основания не могут образовать кодон; они пропускаются и сообщаются как неполный последний кодон.

Больше инструментов