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Calculateur de masse moléculaire ADN / oligo

Calculez la masse moléculaire d'une séquence d'ADN, d'ADNdb ou d'ARN d'après la composition en bases, avec longueur, GC% et conversion nmol↔µg.

À propos de cet outil

Le calculateur de masse moléculaire ADN / oligo est un outil gratuit, dans le navigateur, qui estime la masse moléculaire d'une séquence d'acide nucléique d'après sa composition en bases. Collez une séquence d'ADN ou d'ARN, choisissez ADN simple brin, ADN double brin ou ARN, et il renvoie la masse moléculaire en g/mol ainsi que la longueur, la teneur en GC et une conversion nanomole vers microgramme. Les séquences sont traitées localement dans votre navigateur et ne sont jamais envoyées.

La masse est la somme des masses anhydres des nucléotides monophosphates moins une correction de 61,96 g/mol pour le retrait d'un phosphate à l'extrémité 5′. Les bases d'ADN utilisent dA 313,21, dT 304,2, dC 289,18, dG 329,21 ; l'ARN utilise A 329,21, U 306,17, C 305,18, G 345,21. Pour l'ADN double brin, l'outil ajoute la masse du brin complémentaire (A↔T, C↔G), de sorte que l'ADNdb ≈ 2× le brin simple.

Les conversions de quantité utilisent µg = nmol × MW ÷ 1000, et l'outil indique aussi les µg par nmol (MW ÷ 1000). Cela donne une MW approximative adaptée à la commande et à la remise en suspension d'oligos ; il ne compte que A, T/U, G et C, donc les codes d'ambiguïté ou les modifications ne sont pas inclus.

Foire aux questions

Quelles masses sont utilisées pour chaque base ?
Masses anhydres des monophosphates : ADN dA 313,21, dT 304,2, dC 289,18, dG 329,21 ; ARN A 329,21, U 306,17, C 305,18, G 345,21 g/mol. Le brin sommé subit ensuite un retrait de 61,96 pour la correction du phosphate 5′.
Comment l'ADN double brin est-il traité ?
Le brin complémentaire est généré par appariement de bases (A↔T, C↔G) et sa masse est ajoutée au brin sens, de sorte que la masse moléculaire de l'ADNdb est à peu près le double d'un brin simple de même longueur.
Comment convertir entre nmol et µg ?
La masse en microgrammes est µg = nmol × MW ÷ 1000, et le calculateur montre aussi les µg par nmol, qui valent MW ÷ 1000. Saisissez la quantité en nanomoles pour voir la masse correspondante.
Est-ce une masse moléculaire exacte ?
C'est une approximation proche utilisant les masses de bases standard et la correction de phosphate courante de 61,96, idéale pour les oligos et amorces. Elle ignore les modifications chimiques, les codes d'ambiguïté et les chimies d'extrémité, et ne compte que A, T/U, G et C.

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