Informazioni su questo strumento
Incolla una sequenza di DNA o RNA per misurarne la composizione in basi. La sequenza viene resa maiuscola e ridotta ad A, C, G, T e U, quindi ogni base viene contata. Tutto viene calcolato localmente nel tuo browser.
Il contenuto in GC è la frazione di basi che sono guanina o citosina: GC% = (G + C) / totale × 100. Il contenuto in AT è semplicemente 100 − GC%. Lo skew GC, definito come (G − C) / (G + C), indica il bias del filamento ed è spesso usato per localizzare le origini di replicazione. I conteggi delle basi e la lunghezza totale sono riportati insieme a questi valori.
Una dimensione della finestra facoltativa divide la sequenza in segmenti consecutivi ed elenca il GC% locale di ciascuno, il che aiuta a individuare le regioni ricche o povere di GC. Per esempio la sequenza GGCC è al 100% GC, mentre una sequenza bilanciata si attesta intorno al 50%.