GC-gehalte Calculator

Over deze tool

Plak een DNA- of RNA-sequentie om de basensamenstelling te meten. De sequentie wordt naar hoofdletters omgezet en teruggebracht tot A, C, G, T en U, waarna elke base wordt geteld. Alles wordt lokaal in je browser berekend.

Het GC-gehalte is de fractie basen die guanine of cytosine is: GC% = (G + C) / totaal × 100. Het AT-gehalte is eenvoudigweg 100 − GC%. GC-skew, gedefinieerd als (G − C) / (G + C), duidt op strengbias en wordt vaak gebruikt om replicatie-oorsprongen te lokaliseren. Basentellingen en de totale lengte worden naast deze cijfers gerapporteerd.

Een optionele venstergrootte splitst de sequentie in opeenvolgende segmenten en toont het lokale GC% van elk, wat helpt om GC-rijke of GC-arme gebieden op te sporen. Zo is de sequentie GGCC 100% GC, terwijl een gebalanceerde sequentie rond de 50% ligt.

Veelgestelde vragen

Hoe wordt het GC-gehalte berekend?

Het is het aantal G- en C-basen gedeeld door het totale aantal basen, uitgedrukt als percentage: GC% = (G + C) / lengte × 100. Het AT-gehalte is de resterende 100 − GC%.

Wat is GC-skew?

GC-skew is (G − C) / (G + C). Een waarde boven nul betekent meer guanine dan cytosine op die streng; het wordt vaak gebruikt om replicatie-oorsprongen en -terminals te helpen identificeren.

Wat doet de venstergrootte?

Het verdeelt de sequentie in opeenvolgende blokken van die lengte en rapporteert het GC% van elk blok, zodat je kunt zien hoe het GC-gehalte langs de sequentie varieert.

Werkt het voor RNA?

Ja. Uracil (U) wordt samen met thymine (T) geteld, zodat zowel RNA- als DNA-sequenties correcte GC- en AT-percentages geven.

Over deze tool

Veelgestelde vragen

Meer tools