Acerca de esta herramienta
Pega una secuencia de ADN o ARN para medir su composición de bases. La secuencia se pasa a mayúsculas y se reduce a A, C, G, T y U, y luego se cuenta cada base. Todo se calcula localmente en tu navegador.
El contenido GC es la fracción de bases que son guanina o citosina: GC% = (G + C) / total × 100. El contenido AT es simplemente 100 − GC%. El sesgo GC, definido como (G − C) / (G + C), indica el sesgo de cadena y suele usarse para localizar orígenes de replicación. Los recuentos de bases y la longitud total se informan junto con estas cifras.
Un tamaño de ventana opcional divide la secuencia en segmentos consecutivos y enumera el GC% local de cada uno, lo que ayuda a detectar regiones ricas o pobres en GC. Por ejemplo, la secuencia GGCC tiene un 100% de GC, mientras que una secuencia equilibrada se sitúa cerca del 50%.